Anaerococcus marasmi (Marseille-P3557T)

Anaerococcus marasmi sp. nov. strain Marseille-P3557T adalah spesies bakteri baru yang berhasil diisolasi dari sampel feses seorang anak Nigeria penderita Marasmus. Genus bakteri ini pertama kali ditemukan melalui skrining cepat menggunakan metode MALDI-TOF MS, dan bakteri ini diklasifikasikan kedalam famili Peptoniphilaceae. Identifikasi dan determinasi spesies bakteri dilakukan secara morfologi, biokimiawi, dan pendekatan molekuler.

{tocify} $title={Daftar isi}

A. Isolasi dan Kondisi Pertumbuhan Bakteri

Bulan April Tahun 2016 bakteri berhasil diisolasi dari sampel feses seorang anak Nigeria yang menderita Marasmus. Marasmus adalah salah satu bentuk kekurangan gizi yang buruk paling sering ditemui pada balita penyebabnya antara lain karena masukan makanan yang sangat kurang, infeksi, pembawaan lahir, prematuritas, penyakit pada masa neonatus serta kesehatan lingkungan.

Bakteri diisolasi dengan cara menumbuhkan pada medium agar yang mengandung 5% darah domba yang diperkaya dengan agar Columbia (bioMerieux, Marcy I'Etoile, France).

Inkubasi dilakukan selama 15 hari pada suhu 37 °C dalam kondisi anaerob menggunkan botol kedap udara yang mengandung medium Brucella. 

B. Karakter Fenotip Bakteri

• Koloni bakteri yang tumbuh pada medium berwarna putih, dengan permukaan halus, dan berbentuk seperti kawah (crateriform) dengan diameter 1 - 4 mm. 
• Sel bakteri bersifat katalase positif, oksidase negatif, Gram positif (+), berbentuk basil/batang dengan panjang 1,5 - 2,1 μm dan lebar 0,5 - 0,7 μm. 
• Uji Biokimiawi dengan strip API 50 CH dan ZYM (bio Merieux) pada kondisi anaerobik dengan suhu 37 °C, menunjukkan hasil reaksi positif pada uji leusin arilamidase, asam fosfat, β-glukuronidase, gliserol, glukosa, fruktosa, manosa, salisin D-galaktosa, D-melibiose, sukrosa dan potasium 5-ketoglukonat. Reaksi negatif terdapat pada uji arabinosa, ribosa, ramnosa, metil β-D xylopyranoside, inositol, manitol, metil α-glukopiranosid, amigdalin, eskulin, starch, glikogen, D-fruktosa dan D-arabitol.

 

 

Mikrograf SEM bakteri Anaerococcus marasmi sp. nov. strain Marseille-P3557T  

C. Informasi Genetik Bakteri

• Sekuen nukleotida 16S rRNA bakteri Anaerococcus marasmi sp. nov. strain Marseille-P3557T memiliki kemiripan sebesar 97,6 % terhadap Anaerococcus prevotii strain 20548 (GeneBank no. akses NR_074575.I).
• Analisis filogenetik sekuen nukleotida 16S rRNA berkerabat dekat dengan Anaerococcus prevotii strain 20548 (nilai 89) dan mempunyai perbedaan sebesar >1,3%.
• Genom bakteri Anaerococcus marasmi sp. nov. strain Marseille-P3557T berukuran 2.130.060 pasang basa (bp) dengan konten G+C sebesar 45.4 %.
• Analisis dengan aplikasi OrthoANI menunjukkan kekerabatan dekat dengan Anaerococcus marasmi dan Anaerococcus aminiphila (62, 55%), Anaerococcus abesiensis dan Anaerococcus vaginalis (96,47%).

D. Sumber dan Referensi

• Tall, M.L., Pham, T.P.T, Bellali, S., Ngom, I. I., Delerce, J., Lo, C, I, Raoult, D., dan Levasseur, A. 2020. Anaerococcus marasmi sp. nov., a new bacterium isolated from human gut microbiota.  New microbe and New Infect Journal 2020; 35: 100655, Elsivier Publisher. 

Follow

MicrobeHolic Halaman untuk berbagi informasi seputar dunia Mikroba dengan bidang ilmu yang berkorelasi

Share this post